La pandémie de COVID-19 a accéléré la recherche et l’innovation dans de nombreux domaines de la médecine. La pandémie a mis en lumière la manière dont la maladie reflète des interrelations dynamiques et hétérogènes entre les caractéristiques physiques, la génétique, les comorbidités, les expositions environnementales et les déterminants socio-économiques de la santé tout au long de la vie.
Dans un nouvel article publié dans Frontiers in science, les auteurs explorent la manière dont les scientifiques et autres parties prenantes doivent collaborer de façon audacieuse et interdisciplinaire à ces nouvelles frontières de la médecine, en se concentrant sur les maladies transmissibles, la médecine de précision/personnalisée, la médecine systémique et la science des données.
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EDITH est un projet européen qui a pour objectif de développer un référentiel commun et basé sur le cloud de jumeaux numériques (données, modèles, algorithmes et bonnes pratiques) dans le domaine de la santé. EDITH partage des documents collaboratifs pour la rédaction de sa feuille de route. Valorisant les différentes expertises, l’équipe EDITH souhaite s’assurer que chaque voix soit entendue et que la feuille de route représente les perspectives et recommandations de l’ensemble de l’écosystème.
Tous les contributeurs à la feuille de route finale seront mentionnés. Les sujets qui génèrent le plus de commentaires seront portés à la communauté de pratique sur Slack pour faciliter une discussion plus interactive.
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Certains efforts de découverte de médicaments basés sur l’IA et axés sur des protéines connues se sont révélés fructueux, soutenus par l’existence de données de bonne qualité. Cependant, pour les pathologies complexes du système nerveux central (SNC), soit la cible est inconnue, soit il n’existe pas de cible unique susceptible d’apporter l’apaisement nécessaire. PsychoGenics s’attaque de front à la complexité du SNC, en prédisant l’efficacité de nouveaux mécanismes d’action polypharmacologiques inconnus ou de composés axés sur une cible, à l’aide d’une plateforme de découverte de médicaments basée sur l’lA, indépendante de la cible.
Les médicaments les plus efficaces utilisés en clinique présentent généralement une polypharmacologie, modulant plusieurs cibles simultanément. Les plateformes PsychoGenics peuvent contribuer à plusieurs aspects du processus de découverte de médicaments, depuis le criblage de composés jusqu’à l’optimisation des pistes pour faciliter la découverte de nouveaux traitements polypharmacologiques.
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Samantha Atkins, PhD, est scientifique à la division Investigative Pathology de Moderna. Son objectif est de réduire les risques associés aux nanoparticules lipidiques (LNP), nouveau système d’administration de médicaments, afin de les rendre plus sûrs avant qu’ils ne progressent dans les études sur les PNH (Primates Non Humains). Pour accroître l’efficacité de son programme de recherche, Dr Atkins a commencé à utiliser la puce Emulate Human Liver-Chip pour dépister la toxicité liée aux LNP au lieu de s’appuyer uniquement sur les primates non humains.
Dans une simple analyse de coût, le Dr Atkins a découvert qu’elle était capable de dépister 35 nouveaux LNP dans le Liver-Chip au cours d’une série d’expériences qui a duré 18 mois pour un coût total de 325 000 $. Si elle avait dû dépister le même nombre de LNP à l’aide d’études traditionnelles sur les PNH, cela aurait coûté à Moderna plus de 5 000 000 $ et aurait pris plus de 5 ans.
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Sartorius, leader dans les sciences de la vie et les bioprocédés, étend sa collaboration avec NVIDIA pour améliorer le développement de thérapies innovantes. Sartorius utilise la technologie de NVIDIA depuis 2020, en l’intégrant dans ses plateformes d’imagerie de cellules vivantes. Cette intégration prend en charge les applications informatiques de pointe et permet des analyses basées sur l’IA pour une utilisation en laboratoire.
L’un des principaux domaines d’intérêt a été le développement de modèles d’IA prédictifs pour les organoïdes dérivés de cellules souches, qui sont sur le point de remplacer les modèles animaux dans la découverte de médicaments et la médecine de précision. De plus, Sartorius utilise les solutions de NVIDIA pour concevoir et simuler des bioprocédés essentiels au développement de nouvelles thérapies.
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Owkin, une société pionnière de BioTech exploitant l’IA causale (une technique qui peut mettre en évidence la causalité plutôt que la simple corrélation) pour la découverte précise de médicaments, a annoncé une expansion significative de sa banque de médicaments en oncologie et en immunologie. Ce développement fait suite à un accord de licence stratégique mondial avec Idorsia pour développer et commercialiser OKN4395, un double inhibiteur prometteur des récepteurs prostanoïdes EP2 et EP4.
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En moins de 12 mois d’activité, Noetik, une société basée sur l’IA qui exploite l’apprentissage automatique et des données humaines pour la découverte de médicaments, a généré des centaines de téraoctets de données humaines à travers une pile de données incluant la génomique, la transcriptomique et la protéomique pour permettre le développement de modèles de base pour biologie cellulaire et tissulaire. Le financement de 14 millions de dollars soutiendra les importants efforts internes de génération de données de Noetik et le développement continu de méthodes d’apprentissage automatique basées sur des transformateurs.
« La technologie aura un impact considérable sur les thérapies en permettant une meilleure prédiction du succès clinique des nouveaux traitements oncologiques. Le plus gros goulot d’étranglement est l’échec clinique, avec un entonnoir de découverte sans cesse croissant. Grâce à l’apprentissage automatique, Noetik peut découvrir les mécanismes de fonctionnement des tumeurs pour débloquer la découverte de thérapies de nouvelle génération d’oncologie de précision », a déclaré James Hardiman, associé général, DCVC.
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La startup d’immunologie Parallel Bio a publié un modèle in vitro du système immunitaire humain qui est censé capturer la façon dont les immunothérapies affectent le corps avec plus de précision que les animaux. Ce que l’on appelle “l’essai clinique in vitro” permettrait aux entreprises pharmaceutiques d’économiser jusqu’à un milliard de dollars et plus de six ans de temps de développement.
“Il est clair que la dépendance de l’industrie à l’égard de l’expérimentation animale et des essais cliniques traditionnels doit être repensée. Nous pensons que la biologie humaine elle-même détient la réponse à un avenir où les médicaments sont découverts plus rapidement que jamais”, a déclaré Juliana Hilliard, cofondatrice et directrice scientifique de Parallel Bio.
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Une équipe de l’Institut Curie a développé une méthode d’imagerie permettant de suivre le devenir des cellules souches au fur et à mesure de leur différenciation en neurones fonctionnels. Ces résultats ont été publiés dans Nature Cell Biology le 28 mars 2024 et permettent de mieux comprendre les mécanismes sous-jacents à la diversité et à l’expansion neuronales observées dans le cortex cérébral humain.
Le reste du projet se concentre sur le rôle des facteurs microenvironnementaux influençant le futur des cellules, afin de mieux comprendre les moteurs de cette diversité neuronale. « Et nous avons aussi des collaborations en cours : cette technique peut être utilisée pour étudier n’importe quelle lignée cellulaire, à partir de n’importe quel organe. Nous avons par exemple un projet avec Geneviève Almouzni dans le cadre du programme PEPR Cell-ID, pour étudier les destinées cellulaires aberrantes impliquées dans le développement de tumeurs pédiatriques » conclut Alexandre Baffet.
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Plus de 140 médicaments potentiels pour traiter la maladie d’Alzheimer sont actuellement en cours de développement. La barrière hémato-encéphalique est formée de cellules spécialisées qui protègent les tissus cérébraux des toxines et autres contaminants potentiels qui pourraient atteindre le cerveau par la circulation sanguine. Normalement, c’est une bonne chose. Mais les médicaments prometteurs contre la maladie d’Alzheimer sont également bloqués par cette barrière hémato-encéphalique, limitant ainsi leurs chances de succès.
Le projet IM2PACT a développé une nouvelle méthode qui permet d’extraire simultanément les cellules endothéliales et toutes les autres cellules cérébrales avec des rendements élevés. Ce nouveau développement permet désormais de mieux comprendre la barrière hémato-encéphalique, ce qui à son tour pourrait potentiellement améliorer les performances des médicaments contre la maladie d’Alzheimer actuellement en cours d’essais.
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Lire l’article évalué par des pairs dans Nature Communications
Le 22e congrès international ESTIV 2024 — 3 – 6 Juin